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07481005 生物信息学综合分析-生物技术(动物)专业实习项目卡

发布日期:2010-04-10    点击:

idh吉林大学动物科技实验教学中心

实习一、文献检索与开题报告

(一)实习内容:使用OMIM和PubMed进行文献综述的整理与写作。

(二)实习要求:学生亲自上机操作,教师指导。

(三)学时分配:2d

实习二、基因的模拟克隆

(一)实习内容:使用Gene数据库进行基因的查询与引物设计。

(二)实习要求:学生亲自查询,教师帮助进行序列的去冗余化,并使用Primer5、Oligo6进行引物设计。

(三)学时分配:1d

实习三、基因的同源比对

(一)实习内容: 使用Blast进行目的基因的同源性比对。

(二)实习要求:学生亲自上机操作,教师指导,加深学生对打分矩阵的认识。

(三)学时分配:1d

实习四、基因的载体选择与流程图绘制

(一)实习内容:根据实验的需求,在载体数据库进行载体的选择,并使用SimVector进行流程图绘制。

(二)实习要求:学生亲自动手,教师现场指导。

(三)学时分配:1d

实习五、基因的功能分析

(一)实习内容:使用Genequest对基因进行DNA序列分析,使用Prosite进行蛋白质的结构分析。

(二)实习要求:学生亲自动手,教师现场指导

(三)学时分配:1d

实习六、基因的系统发育研究

(一)实习内容:基于EMBL_Clustalw进行系统发育研究

(二)实习要求:学生亲自上机操作,教师现场指导

(三)学时分配:1d

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